Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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