Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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