Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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MKRN4PQ13434 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN4PQ13434 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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