Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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