Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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