Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGF29Q96ES7 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGF29Q96ES7 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGF29Q96ES7 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGF29Q96ES7 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGF29Q96ES7 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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