Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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