Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF2H3Q13889 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms