Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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