Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NMBRP28336 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NMBRP28336 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NMBRP28336 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms