Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPRGP23470 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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