Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 TRAPPC2-201ENST00000359680 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRHP20396 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 CASP12-203ENST00000422698 1685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 STXBP5L-204ENST00000471454 3813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms