Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms