Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRRIQ1Q96JM4 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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