Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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BRD3Q15059 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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BRD3Q15059 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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