Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms