Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ATP1A4Q13733 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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