Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PRPF4BQ13523 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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