Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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