Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SPC24Q8NBT2 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms