Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms