Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 EGFLAM-AS1-201ENST00000508986 331 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 LINC02489-201ENST00000527239 354 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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