Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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