Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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