Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CEP290O15078 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CEP290O15078 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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CEP290O15078 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CEP290O15078 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CEP290O15078 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CEP290O15078 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CEP290O15078 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CEP290O15078 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CEP290O15078 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CEP290O15078 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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