Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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