Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms