Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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