Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RN7SKP7-201ENST00000410540 285 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RPSAP76-201ENST00000444599 853 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL513314.1-201ENST00000455363 318 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 FTO-217ENST00000637001 1609 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 WDR11-AS1-203ENST00000598981 2242 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC073508.2-201ENST00000476049 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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HOXD11P31277 PARM1-202ENST00000513238 4308 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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HOXD11P31277 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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HOXD11P31277 SERAC1-202ENST00000367104 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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HOXD11P31277 NECAP1-216ENST00000639167 2197 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 DCX-201ENST00000356220 3019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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HOXD11P31277 MTFR1L-204ENST00000374307 1868 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC012508.1-201ENST00000564121 4476 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 HCAR2-201ENST00000328880 2051 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AC020604.1-201ENST00000622979 1909 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HOXD11P31277 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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