Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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PTPRAP18433 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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