Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL137145.2-201ENST00000399868 3086 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SEPT4-216ENST00000580844 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU1-8P-201ENST00000384328 165 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPS10P2-201ENST00000430953 494 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CYP4F25P-201ENST00000446871 520 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC048383.1-201ENST00000558226 527 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC008966.1-203ENST00000499459 3137 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR7A17-201ENST00000327462 1127 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR1184-2-201ENST00000408263 99 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR1184-1-201ENST00000408606 99 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR1184-3-201ENST00000408676 99 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms