Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
LINC00587B1AMM8 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms