Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTXN3Q4LDR2 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms