Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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