Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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CHD4Q14839 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHD4Q14839 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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