Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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