Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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