Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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CASQ1P31415 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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