Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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