Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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