Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms