Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL4A6Q14031 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL4A6Q14031 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL4A6Q14031 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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