Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PWP1Q13610 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms