Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
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