Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms