Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms