Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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HOXA2O43364 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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