Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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