Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
MIS18AQ9NYP9 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms