Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NRF1Q16656 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms